iPhotoライブラリの一部の写真が iPhoneに同期しない

こないだの飲み会での出来事。友人に忘年会の写真を iPhoneで見せようとしたら、「ありゃ、ない」。写真の一部が同期されていないようです。
帰宅後調べてみると、iPhotoライブラリに記録された写真の枚数と iTunesが認識している枚数がぜんぜん合わないのです。

iPhoto 2876枚

iTunes 2484枚

同じ日に撮った写真でも同期されるものとされないものがあります。
ためしに iPod Photo Cacheフォルダを捨ててみたけど効果なし。捨てた後の最初の同期で変なこと聞いてきますが無視。

ハードディスクを交換に伴い、バックアップからデータをリストアしたことと関係ありそうですが、どうなっているんだかさっぱりわかりません。

※追記　動作環境